Se muestra como el escarabajo de Darwin lucha en las copas de los árboles con sus grandes mandíbulas curvadas, 5 millones de mariposas monarca que migran 2500 km navegando gracias al sol, un escarabajo bombardero a cámara superlenta disparando liquido hirviendo a sus enemigos, un ejército de abejas sometiendo a un oso saqueador, hormigas cortadoras de hojas marchando como un ejército para recolectar hojas para su plantación de hongos.

David Attenborough se pregunta tres cuestiones: ¿Cómo y porqué Darwin llegó a la teoría de la evolución? ¿Porqué pensamos que sus conclusiones son correctas? ¿Y porqué su teoría es más importante que nunca? Veremos sus raices en Leicestershire, donde coleccionaba fósiles de niño, visitaremos la univesidad de Cambridge, donde Darwin y Attenborough estudiaron y donde muchos años después se descubrió la doble hélice del ADN. Terminaremos en el Museo de Historia Natural de Londres, donde Attenborough explicará de qué manera su visión revolucionó el modo en que miramos el mundo.

El documental cuenta la historia de la teoría de la evolución por la selección natural, que es hoy ortodoxia científica, pero que cuando fue revelada causó mucha controversia. Mucha gente la criticó por la falta de evidencias experimentales y Darwin, siendo honesto, coincidía con ellos, pero confiaba en que las futuras generaciones completarían su trabajo. El profesor de biología evolutiva Armand Marie Leroi argumenta que con la nueva ciencia de la biología del desarrollo evolutivo es posible llevar a esta teoría a un nuevo nivel, explicando como evolucionaron las criaturas en el pasado y empezar a predecir como pueden evolucionar en el futuro.

El debate entre la religión y la evolución ha sido secuestrado por los extremistas. Por un lado están los creyentes fundamentalistas que rechazan la evolución y en el otro los ateos fundamentalistas que proclaman que la teoría de Darwin excluye la posibilidad de Dios. El filósofo y teólogo Conor Cunningham declara que es el momento para establecer la historia correcta y argumenta que es posible ser a la vez cristiano y aceptar la teoría de la evolución.

Richard Dawkins trata sobre las implicaciones sociales y filosóficas de la Teoría de la Evolución. En Kenia, hablará con el paleontólogo Richard Leakey y con el obispo pentecostal Bonifes Adoyo. Adoyo ha liderado el movimiento que presiona al Museo Nacional de Kenia para marginar su colección de huesos de homínidos, incluyendo el Chico de Turkana. Dawkins discute el darwinismo social y la eugenesia, explicando que no son implicaciones de la teoría de la selección natural. También entrevista al psicólogo Steven Pinker para discutir como la moral puede ser compatible con la teoría de la evolución y explica que la selección sexual juega un papel favorecedor del altruismo y la amabilidad en los humanos compatible con el 'Gen Egoísta'.