Narrada desde ambos lados de la ley, esta serie documental sigue la batalla del FBI para derribar al infame jefe de la mafia John Gotti, ampliamente considerado como una de las figuras más peligrosas en la historia del crimen organizado. A través de los testimonios de periodistas, personalidades reales que ayudaron a derribarlo e incluso ex mafiosos, los productores cuentan la historia del ascenso de Gotti y su posterior caída. La película presenta metraje de archivo, cintas de audio y entrevistas exclusivas. En el primer capítulo, cuando Paul Castellano, el jefe de la familia criminal Gambino, es asesinado en una calle concurrida, solo hay un sospechoso: su antiguo protegido John Gotti.
El Paleontólogo norteamericano Pete Larson y su equipo descubrieron el esqueleto más completo y grande de Tiranosaurio Rex jamás encontrado. Hallado en las tierras baldías de Dakota del Sur, sin embargo el esqueleto fue requisado por el gobierno, a lo que siguió una batalla legal de 10 años con el FBI, el Servicio Nacional de Parques, la Oficina de Asuntos Indígenas y con Maurice Williams, el dueño de las tierras donde los huesos fueron descubiertos. Pete Larson pasó 18 meses en prisión." Tras la emisión del film, la Society of Vertebrate Paleontology emprendió acciones legales para la protección de los fósiles en tierras públicas y criticaron las regulaciones gubernamentales que impiden la ciencia paleontológica
En este sexto y final episodio, el FBI intensifica la búsqueda de un hacker escurridizo que pronto le da un giro a la situación al cuestionar la legalidad de una herramienta clave en la investigación. También descubriremos cómo un hombre es vigilado por el gobierno por una supuesta interferencia electoral rusa. ¿Es el responsable, o sólo un chivo expiatorio de gente más poderosa? Habrá que llegar hasta el final para saberlo.
En el episodio final, nos enteramos de cómo se recompensó a los empleados de la planta 17, y vemos cómo el esquema Ponzi de 65.000 millones de dólares de Madoff se derrumba rápidamente cuando los inversores empiezan a retirar su dinero durante la crisis financiera de 2008. Vemos cómo los hijos de Madoff intentan impedir que su padre extienda cheques de bonificación a los inversores de toda la vida, a los empleados fieles y a la familia extensa para ayudar a amortiguar el golpe. Madoff confiesa el esquema Ponzi y el FBI lo detiene. Tras declararse culpable, Madoff es condenado a 150 años de prisión. Dos años después de conocer el esquema Ponzi, su hijo mayor, Mark, aparece colgado de una tubería, muerto de un aparente suicidio. Su otro hijo muere de linfoma seis años después.
El documental cuenta la escalofriante historia de Abu Zubaydah, el primer detenido de alto valor sometido al programa de Técnicas del Interrogatorio Mejoradas (EIT), de La CIA, que más tarde fueron identificadas como tortura por personas ajenas a la agencia. Nunca acusado de un crimen o permitido de defenderse por su detención, Abu Zubaydah sigue encarcelado en la bahía de Guantánamo, en un limbo Kafkiano en contradicción directa de los propios ideales de la justicia y los procedimientos de Estados Unidos. Veinte años después, el documental revela los orígenes de las operaciones clandestinas que llevaron a Estados Unidos, en la 'Guerra contra el Terror', por un camino de crueldad, mentira y autoengaño. Con nuevas revelaciones y un nivel de detalle hecho posible por varias demandas iniciadas por Gibney y el productor Ray Bonner contra La CIA, relatos de primera mano de los dos primeros interrogadores que interrogaron a Abu Zubaydah, los agentes del FBI Ali Soufan y Stephen Gaudin, una impactante entrevista con el contratista de la CIA James Mitchell, el arquitecto principal del programa de EIT, y una entrevista con Daniel Jones, ex investigador del Senado, el documental descubre las prácticas incompetentes y engañosas que siguió el gobierno de los Estados Unidos para acelerar y legalizar este programa después del 11 de septiembre. Como resultado, la tortura como política gubernamental fue autorizada por los Estados Unidos por primera vez en la historia.
En el primer capítulo, cuando Paul Castellano, el jefe de la familia criminal Gambino, es asesinado en una calle concurrida, solo hay un sospechoso: su antiguo protegido John Gotti.