La doctora Janina Ramirez desvela los secretos de los manuscritos ilustrados que fueron encargados por los reyes y explora el mundo medieval que revelan. En 'Gobernando con los Libros', Janina empieza su viaje con los primeros gobernantes anglosajones que crearon una Inglaterra unida, encontrando libros en la Biblioteca Real Británica de hace unos mil años, y un árbol genealógico de 5 metros de largo.
Janina descubre un rey famoso por perseguir monjas y lee un libro creado como regalo de bodas para un príncipe de 19 años. Deambulará desde Westminster Abbey a otras antiguas cunas espirituales inglesas como Winchester, St Albans y Malmesbury, y comprueba por sí misma como las pieles animales pueden ser transformadas en pergaminos de calidad.

El profesor Robert Bartlett, una autoridad en el medievo, presenta una serie que examina el pensamiento en la época medieval. En el segundo episodio, Bartlett muestra pruebas destacables de las complejas pasiones de los hombres y mujeres en la Edad Media. La iglesia predicaba la renuncia a la carne, promoviendo el culto a la virginidad y condenaba a las mujeres como las pecadoras herederas de Eva. Aunque fue en esta época donde nació la idea del amor romántico.

Para nuestros antepasados el mundo parecía misterioso, incluso encantado. Bestias mitológicas, hombres con cabeza de perro y seres mágicos eran comunes. El mundo en sí era solo un libro escrito por Dios. Pero con el tiempo, el mundo tornó a ser un lugar para ser comprendido y dominado.

En el ultimo episodio, el doctor Al-Khalili busca pistas que demuestren que la revolución científica de los siglos XVI y XVII en Europa tuvo sus raíces en el islam medieval y los grades avances astronómicos hechos por los eruditos musulmanes ayudaron al trabajo de astrónomos europeos como Copérnico. También investiga porqué declinó luego la ciencia en el mundo musulmán para reemerger en el presente.

El profesor Al-Khalili nos muestra como el gran astrónomo y matemático Al-Biruni estimó el tamaño de la tierra con un error de tan solo unos cientos de kilómetros y como los eruditos islámicos convirtieron las prácticas mágicas de la alquimia en la moderna química. En El Cairo, el físico Ibn al-Haytham estableció las bases de la óptica y demostró que la luz viaja en línea recta. Al-Khalili argumenta que estos eruditos estuvieron entre los primeros en insistir que las teorías científicas deben fundamentarse en observaciones experimentales, llevando el rigor a la ciencia.