El escritor de viajes Simon Reeve se embarca en dos viajes largos a través de Turquía, explorando este bello y dramático pais, que se encuentra en el centro de sucesos con resonancia mundial. En el primer episodio, visitamos Estambul y las playas y las aguas cristalinas del mar Egeo, antes de terminar en la frontera desgarrada por la guerra con Siria.
En la región que se cree que fue el origen de los primeros viñedos, Simon se encuentra con un productor que ahora intenta vender vino en un país musulmán con un gobierno cada vez más conservador. En Estambul, conoce a algunas de las personas que dan forma a la Turquía moderna, desde leales simpatizantes del controvertido y autoritario presidente de la nación hasta el maestro de obras que construye una de las mezquitas más grandes del mundo y el famoso multimillonario que se beneficia del auge inmobiliario turco.
A lo largo de la famosa Costa Turquesa de Turquía, Simon tiene un sabor de lujo en el hotel más caro del país, pero descubre una industria arrodillada, cómo la guerra en Siria y los atentados terroristas mortales mantienen alejados a millones de turistas.

El científico y militante ateo Richard Dawkins visita Inglaterra, Norteamérica e Israel entrevistando a gente prominente de la fe islámica, judía y de las nuevas sectas Cristianas para expresar su punto de vista de que el fanatismo ha degradado la civilización y continuará degradándola. "El Espejismo de Dios" explora cómo las creencias son tratadas como hechos por muchas religiones y los extremos a los que algunos seguidores han llegado por ello. Dawkins argumenta que el proceso no-lógico llamado fe no es una manera de comprender el mundo, sino que se basa en una oposición a la ciencia moderna y al método científico, y que divide y es peligroso.

En el ultimo episodio, el doctor Al-Khalili busca pistas que demuestren que la revolución científica de los siglos XVI y XVII en Europa tuvo sus raíces en el islam medieval y los grades avances astronómicos hechos por los eruditos musulmanes ayudaron al trabajo de astrónomos europeos como Copérnico. También investiga porqué declinó luego la ciencia en el mundo musulmán para reemerger en el presente.

Dawkins opina que el marco moral de las religiones está deformado, y argumenta en contra del adoctrinamiento religioso de los niños. Discute específicamente la idea de religión vista como un virus en el sentido de un meme. Comienza por explicar cómo un niño está genéticamente programado para creer sin cuestionar la palabra de figuras de autoridad, especialmente los padres – el imperativo de la evolución es que ningún niño sobreviviría al adoptar una actitud escéptica hacia todo lo que dicen sus mayores. Pero este mismo imperativo, afirma, deja vulnerables a los niños a la "infección" por la religión

Se retrata la llegada del Islam al subcontinente indio y uno de los más grandes eras de la historia: Los Mongoles. Michael Wood visita los sufíes de Nueva Delhi, las fortalezas del desierto de Rajastán y las ciudades de Lahore y Agra, donde el presenta una nueva teoría sobre el diseño del Taj Mahal. También nos relata la vida de Akbar, un emperador musulmán que decretó que ninguna religión podía poseer la verdad suprema, pero cuyos sueños de unidad terminaron en una guerra civil.