La segunda parte de esta trilogía trata de localizar las causas de la corrupción social, e intenta ofrecer una solución. Esta solución se basa en una comprensión sobre lo que somos y como nos alineamos con la naturaleza, de la que somos parte. Zeitgeist Anexo aboga por un nuevo sistema social altamente influenciado por el trabajo de toda una vida de Jacque Fresco y el Proyecto Venus.

Cuando era adolescente, Aaron Swartz era un prodigio de la programación informática con una sed insaciable de conocimiento. Después de emerger como un pionero del activismo en Internet, la educación y la política, fue acusado de varios cargos federales en 2011 y 2012, lo que desencadenó una compleja cadena de acontecimientos que dejaron atónita a la comunidad de Internet. Poco después, a la edad de 26, Swartz fue encontrado muerto de un aparente suicidio en su apartamento de Brooklyn.

Vivimos nuestras vidas buscando la felicidad 'allá afuera' como si fuera una mercancía. Nos hemos convertido en esclavos de nuestros propios deseos y anhelos. La felicidad no es algo que pueda ser perseguido o comprado como un traje barato. Esto es Maya, ilusión, el juego interminable de la forma. En la tradición budista, Samsara, o el ciclo interminable del sufrimiento se perpetúa por el deseo de placer y la aversión al dolor. Freud se refirió a esto como el “principio del placer.” Todo lo que hacemos, es un intento de crear placer, para obtener algo que deseamos o para evitar algo que no es deseable, que no queremos. Incluso un organismo simple como el paramecio hace esto. Esto se llama respuesta al estímulo. A diferencia de un paramecio, los humanos tenemos más posibilidades de elección. Somos libres para pensar, y ahí radica el problema. Es pensar en lo que deseamos lo que se ha salido de control. El dilema de la sociedad moderna es que tratamos de entender el mundo no en términos de conciencia interna arcaica, sino cuantificando y calificando lo que percibimos como el mundo externo, a través de medios científicos y mentales. Pensar solo ha llevado a pensar más, y a formular más preguntas. Anhelamos conocer el secreto que crea el mundo y orienta su camino. Pero consideramos esta esencia como si estuviera fuera de nosotros. No como una cosa viviente e inherente a nuestra propia naturaleza. Fue el famoso psiquiatra Carl Jung quien dijo: 'aquel que mira hacia fuera, sueña, aquel que mira hacia adentro, despierta.' No tiene nada de malo desear estar despierto, ser feliz. Lo que está mal es buscar la felicidad fuera cuando solo se puede encontrar en nuestro interior.

El jefe del Shin Bet, el servicio secreto de Israel, es el encargado de la guerra contra el terrorismo y está presente en cada decisión que se toma. Por primera vez, seis antiguos jefes de esta agencia revelan públicamente su visión sobre sus acciones y decisiones, un testimonio exclusivo de sus éxitos y sus fracasos. A lo largo del documental, considerarán sus posiciones y abogarán por una aproximación reconciliatoria basada en la solución de los dos estados.

Richard Dawkins trata sobre las implicaciones sociales y filosóficas de la Teoría de la Evolución. En Kenia, hablará con el paleontólogo Richard Leakey y con el obispo pentecostal Bonifes Adoyo. Adoyo ha liderado el movimiento que presiona al Museo Nacional de Kenia para marginar su colección de huesos de homínidos, incluyendo el Chico de Turkana. Dawkins discute el darwinismo social y la eugenesia, explicando que no son implicaciones de la teoría de la selección natural. También entrevista al psicólogo Steven Pinker para discutir como la moral puede ser compatible con la teoría de la evolución y explica que la selección sexual juega un papel favorecedor del altruismo y la amabilidad en los humanos compatible con el 'Gen Egoísta'.