La serie muestra lo que ocurrió en 1993 en Waco, Texas, cuando David Koresh, el líder de la secta de los Davidianos de la Rama, se enfrentó al gobierno federal en un asedio de 51 días. En el primer episodio, veremos como estalla un primer tiroteo cuando los agentes federales llegan al complejo de la Rama Davidiana con una orden de registro. Más tarde, los negociadores de rehenes intentan sacar a los niños del recinto.
David Koresh había llegado a dirigir su secta a través del matrimonio con Rachel Jones (14 años), hija de uno de los dirigentes de la misma y al que arrinconó enseguida, sustituyéndolo en la cima jerárquica. De todas partes llegaban nuevos adeptos ganados por la persuasiva doctrina de un Koresh que había efectuado compras de armas por valor de más de 250.000 dólares, según él para estar preparados llegado el momento del acoso del «Mal» y se dispuso a convertir en un fortín inexpugnable el rancho Monte Carmelo. Las autoridades acusaron a los davidianos de tenencia masiva de armas y de abusos sexuales con los niños que mantenían a su lado. Recibidos a tiros, los agentes contestaron de igual manera, produciéndose entonces un primer balance de cuatro agentes muertos y una decena de sectarios abatidos, entre ellos el propio David Koresh, herido en el costado izquierdo.

La serie es un examen de infame culto OVNI a través de los ojos de antiguos miembros y sus seres queridos. Lo que empezó en 1975 con la desaparición de 20 personas de una pequeña ciudad en Oregón, terminó en 19977 con el mayor suicidio en suelo estadounidense y cambió la cara de la moderna religión New Age para siempre.
En el primer episodio, Bonnie Nettles y Marshall Applewhite empiezan a reclutar individuos interesados en el cristianismo del fin del mundo, la New Age y los OVNIS. Pero la desaparición de nuevos miembros pronto atrae la atención de los medios de comunicación y los familiares se preocupan.

El científico y militante ateo Richard Dawkins visita Inglaterra, Norteamérica e Israel entrevistando a gente prominente de la fe islámica, judía y de las nuevas sectas Cristianas para expresar su punto de vista de que el fanatismo ha degradado la civilización y continuará degradándola. "El Espejismo de Dios" explora cómo las creencias son tratadas como hechos por muchas religiones y los extremos a los que algunos seguidores han llegado por ello. Dawkins argumenta que el proceso no-lógico llamado fe no es una manera de comprender el mundo, sino que se basa en una oposición a la ciencia moderna y al método científico, y que divide y es peligroso.

Internet nos promete escapar de la realidad. Podemos ir a sitios que nunca pensamos posible y expresarnos como nunca antes, Pero cuando nos sentamos en nuestras casa rodeados de pantallas... ¿somos libres y estamos seguros? En este episodio conoceremos a una mujer enganchada a una secta online desde la seguridad de su dormitorio, a un piloto que sufre hipersensibilidad al electromagnetismo y que solo encuentra alivio en ausencia de circuitos eléctricos y wifi, y a un tetrapléjico que usa la robótica y la realidad virtual para superar las limitaciones de su cuerpo.

Ma Anand Sheela y otros seguidores rememoran sus experiencias al trasladarse al rancho de Oregón y la hostilidad de los residente de la ciudad vecina de Antelope. Con ayuda de arquitectos, ingenieros y los residentes, los rajnísh construyen una ciudad a la que llamarán Rajneeshpuram. La comuna decide autogobernarse para poder emitir sus propios permisos de construcción y tener policía propia.
Los habitantes locales describen su desconfianza, mientras que la prensa empieza a asociar Rajneeshpuram con la masacre de Jonestown y pinta a Bhagwan como un anticristo. El grupo '1000 Amigos de Oregón' inicia acciones legales para desmantelar los edificios de Rajneeshpuram. En respuesta, Sheela empieza a comprar todas las propiedades que puede en Antelope.